योग चिकित्सा केंद्र  मुख्य धारा की चिकित्सा देखभाल में योग प्रणाली को एकीकृत करने के व्यापक दृष्टिकोण के साथ, संस्थान ने सक्षम प्राधिकारी की स्वीकृति प्राप्त करने के बाद निम्नलिखित अस्पतालों/संस्थानों में निम्नलिखित योग चिकित्सा केंद्र शुरू किए हैं:

क. राजनबाबू इंस्टीट्यूट ऑफ पल्मोनरी मेडिसिन एंड ट्यूबरकुलोसिस, ढाका कॉलोनी, किंग्सवे कैंप, दिल्ली-110009

ख. मानव व्यवहार और संबद्ध विज्ञान संस्थान, झिलमिल, दिलशाद गार्डन, दिल्ली-110095

ग. राष्ट्रीय क्षय रोग और श्वसन रोग संस्थान, श्री अरबिंदो मार्ग, नई दिल्ली-110030

घ. वल्लभभाई पटेल चेस्ट इंस्टीट्यूट, दिल्ली विश्वविद्यालय, नॉर्थ कैंपस, दिल्ली-110007

उपरोक्त केंद्रों ने मई, 2007 से काम करना शुरू कर दिया। इन केंद्रों के लिए जनता की  प्रतिक्रिया काफी संतोषजनक है।